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Genome CanadaGenome QuebecUniversité Laval

Nathalie Isabel

Chercheure scientifique
Ressources naturelles Canada
Service canadien des forêts
Centre de foresterie des Laurentides
1055, rue du P.E.P.S.
C. P. 10380, succ. Sainte-Foy
Québec (Québec) G1V 4C7
Canada

Téléphone : (418) 648-7137
Télécopieur : (418) 648-5849
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Intérêts de recherche

Nathalie Isabel est chercheure scientifique pour Ressources Naturelles Canada depuis 1995, au Centre de Foresterie des Laurentides (CFL). Elle est professeure associée de la Chaire de Recherche du Canada en Génomique Forestière et Environnementale de l'Université Laval. Ses travaux de recherche se concentrent principalement sur : 1) le développement de stratégies (cartographie génétique et étude d’association) et d’outils moléculaires pour les programmes d’amélioration génétique et 2) l’acquisition de données empiriques en génétique des populations pour répondre aux besoins des législateurs en matière de protection et de conservation des ressources génétiques.

Les nouvelles approches de la génomique fonctionnelle et celles de l’analyse du transcriptome chez les arbres permettent d’identifier les gènes candidats potentiellement importants pour plusieurs caractères impliqués dans la formation du bois, la croissance et l’adaptation. Son équipe travaille sur le développement de marqueurs de gènes candidats pour ces caractères. Les cartes génétiques assemblées à partir de ces marqueurs permettent de positionner les gènes candidats sur les chromosomes des espèces à l’étude. Ces cartes sont utiles pour la génomique comparative et évolutive de même que pour la dissection génétique des caractères complexes comme la croissance. Le développement de tels marqueurs permettra de réduire la longueur des cycles d’amélioration par une sélection précoce assistée ou encore d’améliorer notre connaissance des gènes importants au niveau adaptatif en vue de la conservation.

Elle s’intéresse également aux risques de contamination génomique des espèces indigènes par les espèces exotiques via le flux génique. À l’aide de son équipe, elle développe des outils moléculaires et des modèles permettant d’évaluer les impacts à court et à long terme des variétés hybrides à composante exotique sur la diversité génétique des espèces indigènes. Par exemple, l’estimation du flux génique entre les plantations exotiques et les peuplements naturels indigènes chez Populus permet d’évaluer et de modéliser en parallèle le risque de contamination pollinique entre les AGMs et ses espèces cousines non modifiées.



Publications

  • Pelgas, B., Beauseigle S, Acheré V, Jeandroz S, Bousquet J, Isabel N. 2006. Overview of the genome organization in the genus Picea by macro-synteny and macro-colinearity studies: correspondence with other Pinaceae. Theoretical and Applied Genetics. In press
  • Lamothe, M., P. Meirmans, and N. Isabel. 2006. A set of polymorphic EST-derived markers for Picea species. Molecular Ecology Notes, on line
  • Koubaa A., N. Isabel, S.Y. Zhang, J. Beaulieu and J. Bousquet. 2005. Transition from juvenile to mature wood in black spruce. Wood and Fiber Science. 37: 445-455.
  • Pelgas B., J. Bousquet, S. Beauseigle, and N. Isabel. 2005. A composite linkage map from two crosses for the species complex (Picea mariana x Picea rubens) and analysis of synteny with other Pinaceae. Theoretical and Applied Genetics 111:1466-88.
  • Gros-Louis, M.-C., J. Bousquet, L. E. Paques, N. Isabel. 2005. Species-specific diagnostic markers in Larix spp. based on RAPDs and nuclear, cpDNA, and mtDNA gene sequences, and their phylogenetic implications. Tree Genetics and Genomes 1 : 50­63.
  • Pelgas B., N. Isabel and J. Bousquet. 2004. Efficient screening for expressed sequence tag polymorphisms (ESTP) by DNA pool sequencing and denaturing gradient gel electrophoresis in spruces. Molecular Breeding 13 : 263­279.
  • Guillet-Claude C., N. Isabel, B. Pelgas, and J. Bousquet. 2004. The evolutionary implications of knox-I gene duplications in conifers: correlated evidence from phylogeny, gene mapping, and analysis of functional divergence. Molecular Biology and Evolution 11: 2232­-2245.
  • Pelgas B., N. Isabel et J. Bousquet. 2003. Efficient screening for expressed sequence tag polymorphisms (ESTP) by DNA pool sequencing and denaturing gradient gel electrophoresis in spruces. Molecular Breeding. In press.
  • Jaramillo-Correa, J.P., M. Bouillé, J. Beaulieu, N. Isabel, M. Perron and J. Bousquet. 2003. Cross-species amplification of mitochondrial DNA sequence-tagged-site markers in Gymnosperms: the nature of polymorphism and variation within and among species in Picea. Theor Appl Genet. 106 : 1353.
  • Gosselin, I., Zhou, Y., Bousquet, J. et Isabel, N. 2002. Megagametophyte-derived linkage maps of white spruce (Picea glauca) based on RAPD, SCAR and ESTP markers. Theor Appl Genet 104 :987-997.
  • Fournier D., Perry D.J., Beaulieu J., Bousquet J. et Isabel, N. 2001. Optimizing expressed sequence tag polymorphisms by single strand conformation polymorphism in spruces. Forest Genetics 9(1): 11-17.
  • Garin E., M. Bernier-Cardou, N. Isabel, K. Klimaszewska and A. Plourde. 2000. Effects of sugar and amino acids on maturation of somatic embryo of Pinus strobus on medium with elevated gellan gum concentrations. Plant Cell Tissue and Organ Culture 62: 27-37.
  • Koubaa A., S.Y. Zhang, N. Isabel, J. Beaulieu, and J. Bousquet. 2000. Juvenile-mature wood correlation in black spruce specific gravity and growth. Wood and Fiber Science 32(1): 61-71.