Co-Directeur Centre de recherche en biologie forestière Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Local 2165 Université Laval Québec (Québec), G1K 7P4 Canada Téléphone : (418) 656-2278 Télécopieur : (418) 656-7493 Courriel : Cliquez ici pour envoyer un courriel à John MacKay Page Internet : Cliquez ici pour accéder à la page Internet de John MacKay

Intérêts de recherche

John MacKay est professeur agrégé au département de sciences du bois et de la forêt de l’Université Laval. Ses activités de recherche portent principalement sur la formation et les caractéristiques du bois chez les arbres forestiers. Il participe au développement et à la mise en œuvre de démarches expérimentales s’appuyant sur la génomique fonctionnelle pour l’étude de ces phénomènes. Le programme de recherche du Dr MacKay intègre plusieurs approches pour étudier la génétique et la biologie moléculaire en lien avec la physiologie et la structure du xylème secondaire, dont le séquençage à grande échelle des gènes exprimés, le développement de biopuces à ADN, l’étude des profils d’expressions des gènes, l’analyse fonctionnelle de gènes qui contrôlent les caractéristiques du bois, la variation génétique du bois et de l’expression des gènes au sein de populations naturelles d’arbres.

Il a dirigé le projet Arborea (2002 à 2006) et codirige le projet Arborea II (2006-2010) financés par Génome Canada et Génome Québec. Entre 2000 et 2005 il a publié 16 articles dans des revues avec comité de lecture et un chapitre de livre sur divers sujets reliés à la génétique et la génomique forestières, présenté 12 conférences invitées, et participé à 45 présentations orales et affiches techniques lors de congrès internationaux, nationaux et régionaux.

Publications

• Pavy, N, Paule, C., Parsons, L, Crow, J., Morency, M.J., Cooke, J., Johnson, J.E., Noumen, E., Guillet-Claude, C., Butterfield, Y., Barber, S., Yang, G., Liu, J,  Stott, J., Kirkpatrick, R., Siddiqui, A., Holt, R., Marra, M., Séguin, A., Retzel, E., Bousquet, J., MacKay., J. 2005. Generation, annotation, analysis and database integration of 16,500 white spruce EST clusters. BMC Genomics, 6: 144-163

• MacKay, J., Park, Y., Becwar, M., Cordero, J., Pullman, G. 2005. Genetics of Somatic Embryogenesis in Loblolly Pine and Implications for Breeding. In press Tree Genetics and Genomes

• Pliura, A. , Yu, Q., Zhang, S. Y., MacKay, J., Périnet, P., Bousquet, J. 2005. Variation in Wood Physical Properties and Their Relation to the Growth of Poplar Hybrids. Forest Science, 51: 472-482

• Tarca , A. L., Cooke , J. E. K. and J. Mackay 2005. A robust neural networks approach for spatial and intensity dependent normalization of cDNA microarray data. Bioinformatics 21: 2674-2683

• Pavy, N., J. Laroche, J. Bousquet and J. Mackay. 2004. Large-scale statistical analysis of pine xylem ESTs lead to the discovery of regulatory genes expressed in root xylem. Plant Molecular Biology. 57 : 203-224

• Egertsdotter, U., van Zyl, L., Mackay, J., Whetten, R., Peter, G. and R. Sederoff 2004. Gene expression profiling during formation of earlywood amd latewood in loblolly pine: expression profiles of 350 genes. Plant Biol., 6:654-663

• MacKay, J., Bérubé, H., Regan, S., Séguin, A. 2003. Functional genomics in forest trees: application to the investigation of defense mechanisms and wood formation. In; Plantation Forest Biotechnology for the 21st Century, C Walter and Mike Carson Eds., 163-180

• Kim, H., Ralph, J., Lu, F., Ralph, S.A., Boudet, A.M., MacKay, J.J., Sederoff, R.R., Ito, T., Kawai, S., Ohashi, H., Higuchi, T. 2003. NMR analysis of lignins in CAD-deficient plants. Part 1. Incorporation of hydroxycinnamaldehydes and hydroxybenzaldehydes into lignins. Org. Biomol. Chem., 1:268-281

• Goujon, T., Sibout, R., Eudes, MacKay, J., Jouanin, L., 2003. Genes involved in the biosynthesis of lignin precursors in Arabidopsis thaliana Plant Physiol. Biochem. 41: 677-687

• Dimmel, D.R,  MacKay, J.J., Courchene, C., White-Hughes, A., Kadla, J., Scott, J.T.,  Holtman, K., Chang, H.M., O’Malley, D. M., and S.E.. McKeand 2002. Pulping and bleaching of partially cad-deficient pine. Journal of Wood Chemistry and Technology, 21: 1-17

• Van Zyl, L., von Arnold, S., Bozhkov. P., Chen, Y., Egertsdotter, U., MacKay, J., Sederoff, R., Shen, J., Zelena, L., Clapham, D. 2002. Heterologous array analysis in Pinaceae: Hybridization of high density arrays of Pinus taeda  cDNA with cDNA from needles and embryogenic cultures of P. taeda, P. sylvestris or Picea abies . Functional and Comparative Genomics, 3: 306-318

• MacKay, J., Dimmel, D., Boon, J. 2001. Pyrolysis MS characterization of wood from CAD-deficient pine. Journal of Wood Chemistry and Technology. 21: 19-29

• Dimmel, D. R., MacKay, J., Althen, E., Parks, C., R. R. Sederoff. 2001. Pulping and Bleaching of CAD-Deficient Wood. Journal of Wood Chemistry and Technology. 21: 1-18

• Ralph, J., Lapierre,  C., Marita, J. M., Kim, H. Lu, F., Hatfield, R. D., Ralph, S., Chapple, C., Franke, R., Hemm, M., Van Doorsselaere, J., Sederoff, R. R., O’Malley, D. M., Scott, J.T., MacKay, J. J., Yahiaoui, N., Boudet, A., Pean, M., Pilate, G., Jouanin, L., Boerjan, W. 2001. Elucidation of new structures in lignins of CAD- and COMT-deficient plants by NMR. Phytochem., 57: 993-1003

• Lapierre, C., Pollet, B., MacKay, J., Sederoff, R. 2000. Lignin Structure in a Mutant Pine Deficient in Cinnamyl Alcohol Dehydrogenase, Journal of Agricultural a Food Chemistry, 48, 2326.

• Cairney J., Xu, N., Mackay, J., Pullman, G. 2000. Transcript profiling; A tool to assess the development of conifer emrbyos. In Vitro Cellular & Developmental Biology, 36: 155-162.