Janice Cooke

Chercheure scientifique
University of Alberta
Department of Biological Sciences
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Canada

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Intérêts de recherche

Janice Cooke est professeure adjointe au Département de Sciences Biologiques à l’Université d’Alberta. Elle a commencé sa carrière de recherche en biologie des arbres forestiers en 1989. Depuis, elle a travaillé dans des institutions de recherche en Colombie-Britannique, dans l’État de Washington, en Alberta, Floride et au Québec.

Le but de sa recherche est de mieux comprendre les mécanismes moléculaires qui sont importants dans la réponse des arbres forestiers aux signaux environnementaux et comment ces réponses moléculaires peuvent affecter la croissance annuelle et l’adaptation au climat. Actuellement, son équipe effectue des recherches sur les bases moléculaires de l’aoûtement, la redistribution d’azote saisonnier et l’utilisation d’azote. L’aoûtement et la redistribution d’azote saisonnier sont des adaptations importantes liées à la dormance qui permet aux plantes vivaces, dont les arbres forestiers, de survivre pendant la période d’hiver au Canada. Les deux processus sont aussi importants pour déterminer la croissance des arbres. Dans le cadre de son programme de recherche, Dre. Cooke aimerait caractériser des événements cellulaires et métaboliques qui jouent un rôle majeur dans ces processus et identifier les gènes qui dirigent ces événements. Afin de découvrir ces événements et ces gènes, l'équipe de Dre. Cooke utilise diverses approches telles que la génomique, la physiologie, la biochimie et la biologie moléculaire.

Publications

Pavy, N., Paule, C., Parsons, L., Crow, J.A., Morency, M.-J., Cooke, J., Johnson, J.E., Noumen, E., Guillet-Claude, C., Butterfield, Y., Barber, S., Yang, G., Liu, J., Stott, J., Kirkpatrick, R., Siddiqui, A., Holt, R., Marra, M., Seguin, A., Retzel, E., Bousquet, J., and MacKay, J. 2005. Generation, annotation, analysis and database integration of 16,500 white spruce EST clusters. BMC Genomics. 6: 144.
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Cooke, J.E.K. and Weih, M. 2005. Nitrogen storage and seasonal nitrogen cycling in Populus: bridging molecular physiology and ecophysiology. New Phytologist. 167: 19-30.
Tarca, A.L., Cooke, J.E.K., and Mackay J. 2005. Robust neural networks approach for spatial and intensity dependent normalization of cDNA microarray data. Bioinformatics 21: 2674-2683.
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Morse, A.M., Cooke, J.E.K., and Davis, J.M. 2004. Functional genomics in forest trees. Chapter 1 in: Molecular Genetics and Breeding of Forest Trees. S. Kumar and M. Fladung, eds. Haworth Press, New York. 450 pp.
Klimaszewska,^,K., Morency, F., Jones-Overton, C., and Cooke, J. 2004. Accumulation pattern and identification of seed storage proteins in zygotic embryos of Pinus strobus L. and in somatic embryos from different maturation treatments. Physiol. Plant. 121: 682-690.
Cooke, J.E.K., Brown, K.A., Wu, R. and Davis, J.M. 2003. Gene expression associated with nitrogen-induced shifts in allocation in poplar. Plant Cell Environ., 26: 757-770.
Cooke, J.E.K., Cooke, B.J., and Gifford, D.J. 2002. Loblolly pine seed dormancy: constraints to germination. New Forests 23: 239-256.
Davis, J.M., Wu, H., Cooke, J.E.K., Reed, M.J., Luce, K.S., and Michler, C.H. 2002. Pathogen challenge, salicylic acid and jasmonic acid regulate expression of chitinase gene homologs in pine. Mol. Plant Microbe Interactions 15: 380-387.
Todd, C.D.¹, Cooke, J.E.K.¹, and Gifford, D.J. 2001. Purification and properties of loblolly pine (Pinus taeda L.) arginase from germinated seedlings. Plant Physiol. Biochem. 39: 1037-1045. ¹These authors contributed equally to this manuscript.
Lawrence, S.D., Cooke, J.E.K., Greenwood, J.S., Korhnak, T.E., and Davis, J.M. 2001. Vegetative storage protein expression during terminal bud formation in poplar. Can. J. For. Res. 31: 1098-1103.
Todd, C.D., Cooke, J.E.K., Mullen, R.T., and Gifford, D.J. 2001. Regulation of loblolly pine (Pinus taeda L.) arginase during germination and post-germinative growth. Plant Mol. Biol. 45: 555-565.